Historia Wydziału Biologii jest integralną częścią historii Uniwersytetu Gdańskiego. Uniwersytet Gdański został utworzony rozporządzeniem Rady Ministrów z dnia 20 marca 1970 roku przez połączenie Wyższej Szkoły Pedagogicznej w Gdańsku z Wyższą Szkołą Ekonomiczną w Sopocie. Założona w 1946 roku Wyższa Szkoła Pedagogiczna dała początek trzem wydziałom nowej uczelni, w tym Wydziałowi Biologii i Nauk o Ziemi (BiNoZ). Dynamiczny rozwój Uniwersytetu Gdańskiego spowodował, że już po dwóch latach od chwili swojego powstania wszystkie wydziały zdobyły prawa doktoryzowania.

Podwaliny kierunku biologia na wydziale BiNoZ położyli wywodzący się z różnych środowisk akademickich w Polsce, w większości nieżyjący już dziś profesorowie - twórcy i organizatorzy kolejno powstających Pracowni, Zakładów i Katedr: Feliks Piotrowski (zoologia bezkręgowców), Hanna Piotrowska (botanika), Karol Taylor (biochemia), Anna Podhajska (mikrobiologia), Stefan Strawiński (zoologia kręgowców), Karol Bijok (cytologia roślin), Teresa Kentzer (fizjologia roślin), Juliusz Tokarski (fizjologia zwierząt) oraz Tadeusz Sywula (genetyka i ewolucjonizm). W tym pionierskim okresie wszystkie jednostki biologiczne mieściły się w jedynym budynku Wydziału - w Gdyni.

Wraz z rozwojem potencjału naukowego i poszerzeniem oferty dydaktycznej część jednostek naukowo-dydaktycznych uzyskała nowe lokalizacje. W 1971 roku przejęto od Instytutu Biologii Akademii Medycznej w Gdańsku Stację Biologiczną w Górkach Wschodnich na Wyspie Sobieszewskiej. W lipcu 1976 roku część jednostek została przeniesiona do budynku przy ulicy Kładki w Gdańsku. Ponadto w roku 1980 od Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu przejęto Stację Badania Wędrówek Ptaków, która do 2008 roku zlokalizowana była w Przebendowie, w dawnym województwie słupskim, a obecnie mieści się w Gdyni. W 1985 roku w miejsce dotychczasowego Wydziału BiNoZ powołano Wydział Biologii, Geografii i Oceanologii (BGiO). W roku 1991 trzy Katedry zostają przeniesione do Gdańska-Wrzeszcza.
W latach 2004-2008 w ramach przygotowań do powołania samodzielnego Wydziału Biologii działał przejściowo Instytut Biologii utworzony na bazie kierunku biologii Wydziału BGiO. 1 maja 2008 roku Senat UG uchwałą nr 35/08 utworzył w Uniwersytecie Gdańskim Wydział Biologii, który rozpoczął działalność dnia 1 września 2008 roku.

Pierwszy dyplom magistra biologii na Uniwersytecie Gdańskim został wydany już w dwa lata po utworzeniu Uniwersytetu, w czerwcu 1972 roku. Pierwszy stopień doktora nauk przyrodniczych w zakresie biologii został nadany w grudniu 1973 roku a doktora habilitowanego szesnaście lat później, w grudniu 1989 roku. Od 1992 roku na Uniwersytecie Gdańskim rozpoczęto nadawanie stopni doktora i doktora habilitowanego nauk biologicznych w zakresie biologii. W 2010 roku Wydział Biologii Uniwersytetu Gdańskiego uzyskał nowe uprawnienia do nadawania stopnia doktora nauk biologicznych w dyscyplinach: ekologii i mikrobiologii